Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms