Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UIMC1Q96RL1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms