Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM44Q96DX7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM44Q96DX7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms