Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
KLHDC4Q8TBB5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
KLHDC4Q8TBB5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
KLHDC4Q8TBB5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KLHDC4Q8TBB5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KLHDC4Q8TBB5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KLHDC4Q8TBB5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KLHDC4Q8TBB5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KLHDC4Q8TBB5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KLHDC4Q8TBB5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KLHDC4Q8TBB5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KLHDC4Q8TBB5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KLHDC4Q8TBB5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KLHDC4Q8TBB5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KLHDC4Q8TBB5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KLHDC4Q8TBB5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KLHDC4Q8TBB5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KLHDC4Q8TBB5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KLHDC4Q8TBB5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms