Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFD5

ARID1B, AT-rich interactive domain-containing protein 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1BQ8NFD5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID1BQ8NFD5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID1BQ8NFD5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms