Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HJURPQ8NCD3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms