Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0Y2

Krt33a, Keratin, type I cuticular Ha3-I, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33aQ8K0Y2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt33aQ8K0Y2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt33aQ8K0Y2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt33aQ8K0Y2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt33aQ8K0Y2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt33aQ8K0Y2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt33aQ8K0Y2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt33aQ8K0Y2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt33aQ8K0Y2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt33aQ8K0Y2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt33aQ8K0Y2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt33aQ8K0Y2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt33aQ8K0Y2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt33aQ8K0Y2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt33aQ8K0Y2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt33aQ8K0Y2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt33aQ8K0Y2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt33aQ8K0Y2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt33aQ8K0Y2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt33aQ8K0Y2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt33aQ8K0Y2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt33aQ8K0Y2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt33aQ8K0Y2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt33aQ8K0Y2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt33aQ8K0Y2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt33aQ8K0Y2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt33aQ8K0Y2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt33aQ8K0Y2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt33aQ8K0Y2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt33aQ8K0Y2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt33aQ8K0Y2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt33aQ8K0Y2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt33aQ8K0Y2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt33aQ8K0Y2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt33aQ8K0Y2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt33aQ8K0Y2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt33aQ8K0Y2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms