Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM48Q8IWZ4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM48Q8IWZ4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms