Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ6

Zer1, Protein zer-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zer1Q80ZJ6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zer1Q80ZJ6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zer1Q80ZJ6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zer1Q80ZJ6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zer1Q80ZJ6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zer1Q80ZJ6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Zer1Q80ZJ6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zer1Q80ZJ6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zer1Q80ZJ6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zer1Q80ZJ6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zer1Q80ZJ6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zer1Q80ZJ6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zer1Q80ZJ6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zer1Q80ZJ6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zer1Q80ZJ6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zer1Q80ZJ6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zer1Q80ZJ6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zer1Q80ZJ6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Zer1Q80ZJ6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zer1Q80ZJ6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zer1Q80ZJ6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zer1Q80ZJ6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zer1Q80ZJ6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zer1Q80ZJ6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zer1Q80ZJ6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zer1Q80ZJ6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zer1Q80ZJ6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zer1Q80ZJ6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zer1Q80ZJ6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zer1Q80ZJ6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Zer1Q80ZJ6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zer1Q80ZJ6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zer1Q80ZJ6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zer1Q80ZJ6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zer1Q80ZJ6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zer1Q80ZJ6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zer1Q80ZJ6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms