Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
HECW1Q76N89 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
HECW1Q76N89 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
HECW1Q76N89 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
HECW1Q76N89 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
HECW1Q76N89 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
HECW1Q76N89 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
HECW1Q76N89 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
HECW1Q76N89 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
HECW1Q76N89 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
HECW1Q76N89 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
HECW1Q76N89 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
HECW1Q76N89 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
HECW1Q76N89 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
HECW1Q76N89 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
HECW1Q76N89 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
HECW1Q76N89 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
HECW1Q76N89 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
HECW1Q76N89 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
HECW1Q76N89 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
HECW1Q76N89 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
HECW1Q76N89 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
HECW1Q76N89 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
HECW1Q76N89 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
HECW1Q76N89 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
HECW1Q76N89 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.38
HECW1Q76N89 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
HECW1Q76N89 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
HECW1Q76N89 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
HECW1Q76N89 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
HECW1Q76N89 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
HECW1Q76N89 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
HECW1Q76N89 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
HECW1Q76N89 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
HECW1Q76N89 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
HECW1Q76N89 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
HECW1Q76N89 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
HECW1Q76N89 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
HECW1Q76N89 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
HECW1Q76N89 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
HECW1Q76N89 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
HECW1Q76N89 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
HECW1Q76N89 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
HECW1Q76N89 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
HECW1Q76N89 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
HECW1Q76N89 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
HECW1Q76N89 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
HECW1Q76N89 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
HECW1Q76N89 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
HECW1Q76N89 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
HECW1Q76N89 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
HECW1Q76N89 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
HECW1Q76N89 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
HECW1Q76N89 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
HECW1Q76N89 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
HECW1Q76N89 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
HECW1Q76N89 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
HECW1Q76N89 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
HECW1Q76N89 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
HECW1Q76N89 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
HECW1Q76N89 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
HECW1Q76N89 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
HECW1Q76N89 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
HECW1Q76N89 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
HECW1Q76N89 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
HECW1Q76N89 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
HECW1Q76N89 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
HECW1Q76N89 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
HECW1Q76N89 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
HECW1Q76N89 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
HECW1Q76N89 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
HECW1Q76N89 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
HECW1Q76N89 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
HECW1Q76N89 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
HECW1Q76N89 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
HECW1Q76N89 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
HECW1Q76N89 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
HECW1Q76N89 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
HECW1Q76N89 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC36.05■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms