Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tpm4Q6IRU2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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