Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms