Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL25

Lhfpl5, LHFPL tetraspan subfamily member 5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl5Q4KL25 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lhfpl5Q4KL25 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lhfpl5Q4KL25 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms