Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pbxip1Q3TVI8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms