Protein–RNA interactions for Protein: Q2HXL6

Edem3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edem3Q2HXL6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Edem3Q2HXL6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Edem3Q2HXL6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Edem3Q2HXL6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edem3Q2HXL6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edem3Q2HXL6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edem3Q2HXL6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edem3Q2HXL6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edem3Q2HXL6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edem3Q2HXL6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edem3Q2HXL6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edem3Q2HXL6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edem3Q2HXL6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Edem3Q2HXL6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Edem3Q2HXL6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Edem3Q2HXL6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edem3Q2HXL6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms