Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 YKR041WYKR041W 753 nt5.17□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 RPC19YNL113W 429 nt5.17□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 YNR048WYNR048W 1182 nt5.17□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 DCI1YOR180C 816 nt5.17□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 DAK1YML070W 1755 nt5.16□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 YRA1YDR381W 681 nt5.16□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 DFM1YDR411C 1026 nt5.16□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 TEF4YKL081W 1239 nt5.16□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 NTR2YKR022C 969 nt5.16□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 ADE3YGR204W 2841 nt5.16□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 ZUO1YGR285C 1302 nt5.16□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 TPO2YGR138C 1845 nt5.16□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 TRM44YPL030W 1704 nt5.15□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 YDR541CYDR541C 1035 nt5.15□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 UBC6YER100W 753 nt5.15□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 SEN34YAR008W 828 nt5.15□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 YBL044WYBL044W 369 nt5.15□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 snR3snR3 194 nt5.15□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 LYS21YDL131W 1323 nt5.15□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 RIM21YNL294C 1602 nt5.15□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 TEF1YPR080W 1377 nt5.15□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 TEF2YBR118W 1377 nt5.15□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 PMT5YDL093W 2232 nt5.15□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 THI20YOL055C 1656 nt5.15□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 ACF2YLR144C 2340 nt5.14□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 ARH1YDR376W 1482 nt5.14□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 SSB1YDL229W 1842 nt5.14□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 SSB2YNL209W 1842 nt5.14□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 MTQ2YDR140W 666 nt5.14□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 PRS2YER099C 957 nt5.14□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 PHA2YNL316C 1005 nt5.14□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 STR2YJR130C 1920 nt5.14□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 DIT1YDR403W 1611 nt5.14□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 HFI1YPL254W 1467 nt5.13□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 UTP7YER082C 1665 nt5.13□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 CAD1YDR423C 1230 nt5.13□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 HPM1YIL110W 1134 nt5.13□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 RSA3YLR221C 663 nt5.13□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 SNN1YNL086W 309 nt5.13□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 CBC2YPL178W 627 nt5.13□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 OMS1YDR316W 1416 nt5.13□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 NOT3YIL038C 2511 nt5.13□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 GLO2YDR272W 825 nt5.12□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 SNM1YDR478W 597 nt5.12□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt5.12□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 CDC43YGL155W 1131 nt5.12□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 YGR011WYGR011W 327 nt5.12□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 SPO7YAL009W 780 nt5.12□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 MTW1YAL034W-A 870 nt5.12□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 YLR126CYLR126C 756 nt5.12□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 TGL4YKR089C 2733 nt5.12□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 PRM7YDL039C 2097 nt5.12□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 TIP20YGL145W 2106 nt5.12□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 MKS1YNL076W 1755 nt5.11□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 YJL206CYJL206C 2277 nt5.11□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.11□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 MRPL25YGR076C 474 nt5.11□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 MAD2YJL030W 591 nt5.11□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 HIR2YOR038C 2628 nt5.11□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 ALG2YGL065C 1512 nt5.11□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 MAD3YJL013C 1548 nt5.11□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 PGM2YMR105C 1710 nt5.11□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 LDB17YDL146W 1476 nt5.1□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 CNL1YDR357C 369 nt5.1□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 YER134CYER134C 537 nt5.1□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 RMR1YGL250W 726 nt5.1□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 GTO1YGR154C 1071 nt5.1□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 AXL2YIL140W 2472 nt5.1□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 YPL260WYPL260W 1656 nt5.09□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 YDR132CYDR132C 1488 nt5.09□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 SMF3YLR034C 1422 nt5.09□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 SPC42YKL042W 1092 nt5.09□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 PGA3YML125C 939 nt5.09□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 TFG1YGR186W 2208 nt5.09□□□□□ -1.59
NFI1Q12216 GRC3YLL035W 1899 nt5.09□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 SHE10YGL228W 1734 nt5.09□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 FOL1YNL256W 2475 nt5.08□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 PRO2YOR323C 1371 nt5.08□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 DXO1YDR370C 1329 nt5.08□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 PUF3YLL013C 2640 nt5.08□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 SSA2YLL024C 1920 nt5.08□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 PAN6YIL145C 930 nt5.08□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 MND2YIR025W 1107 nt5.08□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 YPL014WYPL014W 1146 nt5.08□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 MNN1YER001W 2289 nt5.08□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 GPI18YBR004C 1302 nt5.07□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 TFB3YDR460W 966 nt5.07□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 SUA5YGL169W 1281 nt5.07□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 COG5YNL051W 1212 nt5.07□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 KAP114YGL241W 3015 nt5.07□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 YPL245WYPL245W 1365 nt5.06□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 HRP1YOL123W 1605 nt5.06□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 YDR154CYDR154C 351 nt5.06□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 AAD6YFL056C 639 nt5.06□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 VMA16YHR026W 642 nt5.06□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 YML101C-AYML101C-A 318 nt5.06□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 MDM12YOL009C 816 nt5.06□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 CBP3YPL215W 1008 nt5.06□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 YPR195CYPR195C 330 nt5.06□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 BLM10YFL007W 6432 nt5.06□□□□□ -1.6
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