Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1BQ00975 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms