Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKD1P98161 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKD1P98161 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKD1P98161 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKD1P98161 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKD1P98161 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKD1P98161 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKD1P98161 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKD1P98161 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKD1P98161 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKD1P98161 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKD1P98161 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKD1P98161 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PKD1P98161 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKD1P98161 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKD1P98161 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKD1P98161 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PKD1P98161 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKD1P98161 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKD1P98161 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKD1P98161 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKD1P98161 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKD1P98161 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PKD1P98161 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKD1P98161 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKD1P98161 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKD1P98161 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKD1P98161 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PKD1P98161 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKD1P98161 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PKD1P98161 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKD1P98161 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKD1P98161 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PKD1P98161 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PKD1P98161 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PKD1P98161 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PKD1P98161 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PKD1P98161 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PKD1P98161 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PKD1P98161 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PKD1P98161 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKD1P98161 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PKD1P98161 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKD1P98161 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PKD1P98161 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKD1P98161 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKD1P98161 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKD1P98161 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKD1P98161 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKD1P98161 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PKD1P98161 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKD1P98161 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PKD1P98161 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PKD1P98161 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKD1P98161 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKD1P98161 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PKD1P98161 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PKD1P98161 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKD1P98161 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PKD1P98161 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKD1P98161 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKD1P98161 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKD1P98161 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PKD1P98161 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKD1P98161 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKD1P98161 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PKD1P98161 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PKD1P98161 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PKD1P98161 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKD1P98161 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKD1P98161 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKD1P98161 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKD1P98161 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKD1P98161 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PKD1P98161 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKD1P98161 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKD1P98161 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PKD1P98161 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PKD1P98161 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PKD1P98161 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PKD1P98161 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PKD1P98161 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PKD1P98161 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PKD1P98161 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKD1P98161 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKD1P98161 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PKD1P98161 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKD1P98161 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PKD1P98161 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PKD1P98161 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PKD1P98161 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PKD1P98161 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PKD1P98161 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PKD1P98161 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKD1P98161 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKD1P98161 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKD1P98161 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKD1P98161 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PKD1P98161 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PKD1P98161 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms