Protein–RNA interactions for Protein: P78368

CSNK1G2, Casein kinase I isoform gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2P78368 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1G2P78368 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1G2P78368 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1G2P78368 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1G2P78368 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms