Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVFC1P60507 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms