Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DEFA3P59666 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DEFA3P59666 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DEFA3P59666 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DEFA3P59666 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DEFA3P59666 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DEFA3P59666 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DEFA3P59666 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DEFA3P59666 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DEFA3P59666 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DEFA3P59666 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEFA3P59666 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms