Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	PRE3	YJL001W	648 nt		5.13	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	YJL107C	YJL107C	1164 nt		5.13	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	YLR126C	YLR126C	756 nt		5.13	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	IMD1	YAR073W	1212 nt		5.13	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	RPA49	YNL248C	1248 nt		5.13	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	TFC7	YOR110W	1308 nt		5.13	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	CTT1	YGR088W	1689 nt		5.12	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	RFT1	YBL020W	1725 nt		5.12	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	URA7	YBL039C	1740 nt		5.12	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	TPO2	YGR138C	1845 nt		5.12	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	RRP1	YDR087C	837 nt		5.12	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	COX26	YDR119W-A	201 nt		5.12	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	IPK1	YDR315C	846 nt		5.12	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	snR10	snR10	245 nt		5.12	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	YOR024W	YOR024W	324 nt		5.12	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	WHI4	YDL224C	1950 nt		5.12	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	PRO2	YOR323C	1371 nt		5.12	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	ULA1	YPL003W	1389 nt		5.12	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	ARH1	YDR376W	1482 nt		5.12	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	HIR2	YOR038C	2628 nt		5.11	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	CAB4	YGR277C	918 nt		5.11	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	SPC42	YKL042W	1092 nt		5.11	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	SCO1	YBR037C	888 nt		5.11	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	YPL245W	YPL245W	1365 nt		5.11	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	MPH2	YDL247W	1830 nt		5.11	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	MHF2	YDL160C-A	243 nt		5.1	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	SCW4	YGR279C	1161 nt		5.1	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	YHR045W	YHR045W	1683 nt		5.1	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	XPT1	YJR133W	630 nt		5.1	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	YLL059C	YLL059C	507 nt		5.1	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	PML1	YLR016C	615 nt		5.1	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	RPC19	YNL113W	429 nt		5.1	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	PUS1	YPL212C	1635 nt		5.1	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	TFG1	YGR186W	2208 nt		5.09	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	DNF2	YDR093W	4839 nt		5.09	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	ALG2	YGL065C	1512 nt		5.09	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	APE1	YKL103C	1545 nt		5.09	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	YDR132C	YDR132C	1488 nt		5.09	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	YDL144C	YDL144C	1071 nt		5.09	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	RPL34A	YER056C-A	366 nt		5.09	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	PCL6	YER059W	1263 nt		5.09	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	GTO1	YGR154C	1071 nt		5.09	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	YHR095W	YHR095W	495 nt		5.09	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	ISY1	YJR050W	708 nt		5.09	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	MRP21	YBL090W	534 nt		5.09	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	HOT1	YMR172W	2160 nt		5.09	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	TGL4	YKR089C	2733 nt		5.09	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	MDR1	YGR100W	2853 nt		5.08	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	MMS21	YEL019C	804 nt		5.08	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	tN(GUU)C	tN(GUU)C	74 nt		5.08	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	tN(GUU)F	tN(GUU)F	74 nt		5.08	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	tN(GUU)G	tN(GUU)G	74 nt		5.08	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	tN(GUU)K	tN(GUU)K	74 nt		5.08	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	tN(GUU)L	tN(GUU)L	74 nt		5.08	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	tN(GUU)N1	tN(GUU)N1	74 nt		5.08	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	tN(GUU)N2	tN(GUU)N2	74 nt		5.08	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	tN(GUU)O1	tN(GUU)O1	74 nt		5.08	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	tN(GUU)O2	tN(GUU)O2	74 nt		5.08	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	tN(GUU)P	tN(GUU)P	74 nt		5.08	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	HSX1	tR(CCU)J	72 nt		5.08	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	MRL1	YPR079W	1146 nt		5.08	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	ATG1	YGL180W	2694 nt		5.08	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	GIP1	YBR045C	1920 nt		5.07	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	MUM3	YOR298W	1440 nt		5.07	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	YLH47	YPR125W	1365 nt		5.07	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	LYS21	YDL131W	1323 nt		5.07	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	ROX3	YBL093C	663 nt		5.07	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	ISU2	YOR226C	471 nt		5.07	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	CTS1	YLR286C	1689 nt		5.07	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	SRV2	YNL138W	1581 nt		5.07	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	MMR1	YLR190W	1476 nt		5.07	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	YDL034W	YDL034W	345 nt		5.06	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	TFB3	YDR460W	966 nt		5.06	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	GAL83	YER027C	1254 nt		5.06	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	AUA1	YFL010W-A	285 nt		5.06	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	PEX29	YDR479C	1665 nt		5.05	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	WTM1	YOR230W	1314 nt		5.05	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	RAM1	YDL090C	1296 nt		5.05	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	SNO4	YMR322C	714 nt		5.05	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	YOL035C	YOL035C	303 nt		5.05	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	HSP33	YOR391C	714 nt		5.05	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	HSP32	YPL280W	714 nt		5.05	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	BRL1	YHR036W	1416 nt		5.05	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	MDM34	YGL219C	1380 nt		5.04	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	LPL1	YOR059C	1353 nt		5.04	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	TUB3	YML124C	1338 nt		5.04	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	HST4	YDR191W	1113 nt		5.04	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	MRPL25	YGR076C	474 nt		5.04	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	PCT1	YGR202C	1275 nt		5.04	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	CUE2	YKL090W	1332 nt		5.03	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	YCR097W-A	YCR097W-A	267 nt		5.03	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	ERD1	YDR414C	1089 nt		5.03	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	YER147C-A	YER147C-A	411 nt		5.03	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	SPO12	YHR152W	522 nt		5.03	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	TEF4	YKL081W	1239 nt		5.03	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	TFS1	YLR178C	660 nt		5.03	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	SNN1	YNL086W	309 nt		5.03	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	YMR196W	YMR196W	3267 nt		5.03	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	NOT3	YIL038C	2511 nt		5.03	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	KCC4	YCL024W	3114 nt		5.03	□□□□□ -1.6

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