Protein–RNA interactions for Protein: P51791

Clcn3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn3P51791 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clcn3P51791 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms