Protein–RNA interactions for Protein: P23772

Gata3, Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata3P23772 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata3P23772 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata3P23772 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata3P23772 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata3P23772 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata3P23772 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata3P23772 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata3P23772 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata3P23772 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata3P23772 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata3P23772 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata3P23772 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata3P23772 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms