Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1D1P20393 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms