Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNGR4O95473 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms