Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms