Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gfra2O08842 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gfra2O08842 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gfra2O08842 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gfra2O08842 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gfra2O08842 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gfra2O08842 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gfra2O08842 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gfra2O08842 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gfra2O08842 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gfra2O08842 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gfra2O08842 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gfra2O08842 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gfra2O08842 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gfra2O08842 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gfra2O08842 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gfra2O08842 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gfra2O08842 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms