Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsmbO08540 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsmbO08540 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MsmbO08540 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MsmbO08540 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsmbO08540 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MsmbO08540 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MsmbO08540 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MsmbO08540 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MsmbO08540 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MsmbO08540 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MsmbO08540 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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