Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QQQ9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QQQ9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QQQ9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QQQ9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QQQ9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QQQ9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QQQ9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QQQ9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QQQ9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QQQ9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QQQ9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QQQ9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QQQ9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QQQ9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QQQ9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QQQ9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QQQ9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QQQ9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QQQ9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3QQQ9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3QQQ9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3QQQ9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3QQQ9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3QQQ9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QQQ9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QQQ9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QQQ9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QQQ9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QQQ9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QQQ9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QQQ9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QQQ9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QQQ9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QQQ9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QQQ9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QQQ9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QQQ9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QQQ9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QQQ9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QQQ9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QQQ9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QQQ9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QQQ9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QQQ9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QQQ9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QQQ9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QQQ9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QQQ9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QQQ9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QQQ9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QQQ9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QQQ9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QQQ9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QQQ9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QQQ9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QQQ9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QQQ9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QQQ9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3QQQ9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3QQQ9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3QQQ9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3QQQ9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3QQQ9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3QQQ9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
J3QQQ9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
J3QQQ9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QQQ9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QQQ9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QQQ9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QQQ9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QQQ9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QQQ9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QQQ9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QQQ9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QQQ9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QQQ9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QQQ9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QQQ9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QQQ9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QQQ9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QQQ9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QQQ9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QQQ9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QQQ9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QQQ9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QQQ9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QQQ9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QQQ9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QQQ9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QQQ9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QQQ9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QQQ9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QQQ9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QQQ9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QQQ9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QQQ9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QQQ9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QQQ9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QQQ9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms