Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
H3BQV1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
H3BQV1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
H3BQV1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
H3BQV1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
H3BQV1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
H3BQV1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
H3BQV1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
H3BQV1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
H3BQV1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H3BQV1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H3BQV1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H3BQV1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
H3BQV1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H3BQV1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H3BQV1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H3BQV1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
H3BQV1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
H3BQV1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
H3BQV1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
H3BQV1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
H3BQV1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
H3BQV1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
H3BQV1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
H3BQV1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
H3BQV1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
H3BQV1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
H3BQV1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
H3BQV1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
H3BQV1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
H3BQV1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
H3BQV1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
H3BQV1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
H3BQV1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
H3BQV1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
H3BQV1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
H3BQV1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
H3BQV1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
H3BQV1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
H3BQV1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
H3BQV1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
H3BQV1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
H3BQV1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
H3BQV1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
H3BQV1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
H3BQV1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H3BQV1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
H3BQV1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H3BQV1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
H3BQV1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
H3BQV1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
H3BQV1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H3BQV1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H3BQV1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
H3BQV1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
H3BQV1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
H3BQV1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
H3BQV1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
H3BQV1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
H3BQV1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
H3BQV1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
H3BQV1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
H3BQV1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
H3BQV1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
H3BQV1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
H3BQV1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
H3BQV1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
H3BQV1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
H3BQV1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
H3BQV1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
H3BQV1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
H3BQV1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
H3BQV1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
H3BQV1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
H3BQV1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
H3BQV1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
H3BQV1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
H3BQV1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
H3BQV1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
H3BQV1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
H3BQV1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
H3BQV1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
H3BQV1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
H3BQV1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
H3BQV1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
H3BQV1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
H3BQV1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
H3BQV1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
H3BQV1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
H3BQV1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
H3BQV1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
H3BQV1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
H3BQV1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
H3BQV1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
H3BQV1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
H3BQV1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
H3BQV1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
H3BQV1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
H3BQV1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
H3BQV1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms