Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms