Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms