Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPA4Q9UI42 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms