Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms