Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms