Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms