Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ19

KCTD13, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD13Q8WZ19 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD13Q8WZ19 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms