Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 CSF2RA-203ENST00000381500 1283 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 PRDM2-214ENST00000505823 568 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 MRPS18C-204ENST00000507019 666 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 OTX2-206ENST00000555006 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 Metazoa_SRP.187-201ENST00000616534 281 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AL157712.1-201ENST00000620178 2055 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 ATF2-207ENST00000409833 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 EEF1A1P32-201ENST00000418613 1347 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms