Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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