Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms