Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms