Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms