Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TAF6P49848 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TAF6P49848 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TAF6P49848 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TAF6P49848 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TAF6P49848 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TAF6P49848 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TAF6P49848 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TAF6P49848 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TAF6P49848 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF6P49848 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF6P49848 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms