Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCLMP48507 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLMP48507 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLMP48507 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms