Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TGFBR1P36897 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TGFBR1P36897 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TGFBR1P36897 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TGFBR1P36897 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TGFBR1P36897 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TGFBR1P36897 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TGFBR1P36897 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TGFBR1P36897 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TGFBR1P36897 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TGFBR1P36897 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TGFBR1P36897 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TGFBR1P36897 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TGFBR1P36897 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TGFBR1P36897 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TGFBR1P36897 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TGFBR1P36897 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TGFBR1P36897 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TGFBR1P36897 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TGFBR1P36897 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TGFBR1P36897 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TGFBR1P36897 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TGFBR1P36897 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TGFBR1P36897 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TGFBR1P36897 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TGFBR1P36897 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TGFBR1P36897 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TGFBR1P36897 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TGFBR1P36897 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TGFBR1P36897 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TGFBR1P36897 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TGFBR1P36897 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TGFBR1P36897 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms