Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDH7Q9ULB5 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDH7Q9ULB5 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDH7Q9ULB5 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDH7Q9ULB5 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDH7Q9ULB5 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDH7Q9ULB5 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms