Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RB1CC1Q8TDY2 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms