Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms