Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TROQ12816 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TROQ12816 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TROQ12816 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TROQ12816 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TROQ12816 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TROQ12816 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TROQ12816 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TROQ12816 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TROQ12816 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TROQ12816 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TROQ12816 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TROQ12816 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TROQ12816 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TROQ12816 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TROQ12816 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TROQ12816 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TROQ12816 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TROQ12816 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TROQ12816 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TROQ12816 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TROQ12816 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TROQ12816 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TROQ12816 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TROQ12816 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TROQ12816 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TROQ12816 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TROQ12816 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TROQ12816 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TROQ12816 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TROQ12816 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TROQ12816 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TROQ12816 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TROQ12816 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TROQ12816 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TROQ12816 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TROQ12816 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TROQ12816 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TROQ12816 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TROQ12816 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TROQ12816 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TROQ12816 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TROQ12816 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TROQ12816 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TROQ12816 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TROQ12816 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TROQ12816 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TROQ12816 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TROQ12816 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TROQ12816 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TROQ12816 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TROQ12816 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TROQ12816 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TROQ12816 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TROQ12816 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TROQ12816 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TROQ12816 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TROQ12816 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
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